Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms