Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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