Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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RAB39AQ14964 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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