Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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