Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TCIRG1Q13488 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
TCIRG1Q13488 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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