Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms