Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms