Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms