Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TMPOP42166 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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