Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SCN11AQ9UI33 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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SCN11AQ9UI33 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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SCN11AQ9UI33 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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