Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 TRIM43-201ENST00000272395 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PRUNE1-204ENST00000368936 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 FABP5P10-201ENST00000435729 408 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RPL29P25-201ENST00000465069 850 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC093010.2-201ENST00000481773 743 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AP004245.1-201ENST00000530434 259 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RBM4B-207ENST00000531969 769 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC244093.5-201ENST00000619606 718 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 LIPH-201ENST00000296252 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 ZNF304-201ENST00000282286 4202 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 GABRR1-207ENST00000621627 2857 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPOCK3Q9BQ16 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms