Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMIEQ8NEW7 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms