Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CCDC96Q2M329 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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