Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMX3-204ENST00000562706 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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