Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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