Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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