Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CASQ1P31415 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CASQ1P31415 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CASQ1P31415 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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