Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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