Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN9O95484 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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