Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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