Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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GTF3C6Q969F1 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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