Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CCDC38Q502W7 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC38Q502W7 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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