Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDKN3Q16667 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms