Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms