Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms