Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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NCOA4Q13772 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
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