Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms