Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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