Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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BNIP1Q12981 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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BNIP1Q12981 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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BNIP1Q12981 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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BNIP1Q12981 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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BNIP1Q12981 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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