Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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