Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TMPOP42166 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TMPOP42166 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms