Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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HOXA13P31271 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXA13P31271 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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