Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXD10P28358 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD10P28358 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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