Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RPL5P3-201ENST00000493817 889 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HLA-DMAP28067 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms