Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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