Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTPRCP08575 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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