Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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CLDN9O95484 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CLDN9O95484 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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