Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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