Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CLDN19Q8N6F1 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CLDN19Q8N6F1 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CLDN19Q8N6F1 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CLDN19Q8N6F1 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLDN19Q8N6F1 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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