Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
FXNQ16595 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
FXNQ16595 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
FXNQ16595 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms