Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
NFIXQ14938 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms