Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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