Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms