Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CYP4F3Q08477 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms