Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UFM1P61960 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UFM1P61960 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms