Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TTPAP49638 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TTPAP49638 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TTPAP49638 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms