Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 316.27■□□□□ 0.24e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.25■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 316.17■□□□□ 0.184e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 215.92■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 315.75■□□□□ 0.114e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.114e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 515.7■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 515.62■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-216ENST00000464858 633 ntTSL 315.52■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-225ENST00000481341 333 ntTSL 315.38■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 515.38■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 URM1-206ENST00000483206 731 ntTSL 215.1■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 215.06■□□□□ 04e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 215.02■□□□□ -04e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-208ENST00000464649 435 ntTSL 414.85□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 314.73□□□□□ -0.053e-11■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GTPBP2-205ENST00000442748 946 ntTSL 314.5□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GTPBP2-209ENST00000480263 898 ntTSL 214.47□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 REXO5-212ENST00000566993 2549 ntTSL 514.26□□□□□ -0.134e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 URM1-205ENST00000470840 723 ntTSL 213.74□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 313.7□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 513.69□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.234e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GGCX-206ENST00000465637 563 ntTSL 413.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-210ENST00000537653 3563 ntTSL 213.4□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 513.28□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MKI67-204ENST00000478293 654 ntTSL 513.27□□□□□ -0.294e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 313.19□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 312.91□□□□□ -0.344e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.344e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.374e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-213ENST00000539659 2298 ntTSL 212.61□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 STAT2-201ENST00000314128 3259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.459e-10■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 NCAPG-205ENST00000514176 3017 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 EED-211ENST00000534595 713 ntTSL 311.8□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-213ENST00000538149 4797 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-215ENST00000611738 4817 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 STAT2-207ENST00000556539 3278 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.549e-10■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GTPBP2-208ENST00000476510 2816 ntTSL 511.24□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 PANK2-203ENST00000464452 771 ntTSL 311.23□□□□□ -0.614e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-205ENST00000399781 999 ntTSL 311.15□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-216ENST00000616863 4761 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.644e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 URM1-201ENST00000372847 753 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-212ENST00000498133 2662 ntTSL 210.28□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-211ENST00000493680 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.814e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 BCL2L13-204ENST00000399777 2677 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.814e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 59.91□□□□□ -0.824e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.854e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.914e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 CDK4-211ENST00000552254 769 ntTSL 29.24□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 SRSF9-204ENST00000548792 1446 ntTSL 29.09□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -19e-10■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -14e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 STAT2-209ENST00000557199 662 ntTSL 48.13□□□□□ -1.119e-10■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-216ENST00000541654 2688 ntTSL 27.89□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MRPS36-203ENST00000507022 298 ntTSL 37.32□□□□□ -1.244e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 REXO5-203ENST00000561474 617 ntTSL 57.18□□□□□ -1.264e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 56.57□□□□□ -1.364e-8■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.454e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 REXO5-215ENST00000568334 743 ntTSL 35.12□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.64e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.624e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 PA2G4-203ENST00000551061 694 ntTSL 24.14□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 54.05□□□□□ -1.764e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 MGEA5-211ENST00000494347 712 ntTSL 23.96□□□□□ -1.784e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.794e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 EED-204ENST00000524673 1155 ntTSL 33.81□□□□□ -1.84e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 ABHD5-202ENST00000413300 525 ntTSL 33.59□□□□□ -1.834e-6■■■■□ 25.9
RBM22Q9NW64 UBAP2-210ENST00000480885 4572 ntTSL 23.04□□□□□ -1.924e-6■■■■□ 25.9
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 132.4 ms