Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim13Q9CYB0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim13Q9CYB0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim13Q9CYB0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim13Q9CYB0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim13Q9CYB0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms