Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIFKQ9BYG3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms