Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRRTQ9BXP5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRTQ9BXP5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms